中華民國是中國有史以來，第一個以主權在民的理念立國的國體，也是臺灣有史以來，第一個有效地以國家名義在國際間行使主權的國體。以1949年為分界點，兩個階段的民國，既有理念的連續，也有因兩岸之間百年來的複雜關係，以及意識型態的分歧，而出現的現實曲折。
《思考中華民國》從現代化轉型的角度立論，主張中華民國是中西現代化模式的整合，往上回應了王陽明、黃宗羲、王船山等儒者的呼喚，並在十九、二十世紀之際，整合了滾滾西潮帶來的民主體制設想，形成國史上第一個民主體制。本書並從「風土的地緣政治學」、「內在的兩岸性」的觀點著眼，詮釋臺灣與中華民國的內在發展關係，不僅繼承當代新儒家宣言的精神，更反映立足於臺灣的中華民國公民之觀點。